A sua pergunta foi muito clara. Só que o que pede é tão vasto que não cabe numa página destas. Existem mais de cem prefixos, muitos deles com vários significados. Poderá consultar qualquer gramática ou prontuário, onde obterá a informação que deseja. Se quiser restringir o âmbito da sua pergunta, terei todo o gosto em responder-lhe.

No entanto, como apresenta como exemplo um radical com o qual se podem formar palavras sempre com hífen, vou referir-lhe os prefixos que formam palavras sempre com hífen, ou porque têm acento gráfico, ou com determinado significado:

Prefixo

Significado

Exemplos

além-

para lá de, em posição posterior, no espaço ou no tempo

além-mar, além-mundo

aquém-

para cá de

aquém-Atlântico, aquém-fronteiras

co-

a par de, quando o 2.º elemento possui vida autónoma

co-autor, co-herdeiro, co-incineração

ex-

estado anterior, cessação, extinção

ex-marido, ex-ministro

pós-

após, depois de

pós-graduação, pós-verbal

pré-

antes de, prévio

pré-história, pré-romantismo

pró-

a favor de

pró-independência

recém-

há pouco tempo

recém-chegado, recém-nascido.