A frase é exclamativa e o sujeito e o predicativo do sujeito estão invertidos para terem maior realce.
Julgamos que a frase não é apenas exclamativa. Deve ser interrogativa e exclamativa simultaneamente. Assim, a pontuação deverá ser a seguinte:
« – Que é isso?!»
isso – sujeito
é – predicado
que – predicativo do sujeito (aquilo que desejamos saber e pomos em evidência).